L'étude d'échantillons biologiques dans l'ère métagénomique : Présentation travaux

Résumé :

Après une introduction sur la métagénomique, je vous présenterai un cas d’étude concernant 2 éponges méditerranéennes (Oopsacas minuta et Oscarella lobularis). J’exposerai la méthodologie utilisée au cours de mon postdoc et je détaillerai les résultats les plus inattendus. Vous ferez connaissance avec Cenarchaeum massiliensis, une archéobactérie jamais décrite jusqu’à maintenant et appartenant à une famille proposée récemment (2008). Très abondante dans Oopsacas minuta, celle-ci est génétiquement capable d’utiliser l’ammoniaque comme source d’énergie et de produire la vitamine B12. A partir de mes résultats et de la littérature, nous discuterons de la nature de l’interaction entre l’éponge et cette archéobactérie.