L'UMR PVBMT est structurée en 5 équipes de recherche au sein de trois champs thématiques :
Sont pris comme modèles d'étude : 2 genres bactériens (Xanthomonas et Ralstonia), 1 famille de virus (bégomovirus), 2 sous-ordre d'insectes (Tephritidae et Aleyrodidae) et 4 genres de plantes cultivées (Vanilla, Coffea, Saccharum, Solanum).
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