UMR PVBMT

Objectif :

Mieux comprendre les facteurs et les mécanismes impliqués dans l'émergence des bactéries et virus phytopathogènes.

Sont analysées :

• les modifications des génomes et les forces évolutives associées (approche évolutive)
• les modifications des dynamiques épidémiologiques (approche épidémiologique)

Ces deux approches exploitent les outils moléculaires développés entre 2004 et 2008 : hybridation sur puces à ADN, MultiLocus Sequence Analysis (MLSA), Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP), Insertion Sequence Ligation Mediated Polymerase Chain Reaction (IS-LM-PCR), MLVA.

Trois phytopathogènes-modèles :

• Ralstonia solanacearum, bactérie tellurique naturellement compétente, espèce à forte diversité génétique notamment du fait des transferts horizontaux de gènes
• Xanthomonas citri, bactérie à dissémination aérienne, assez peu polymorphe.
• Bégomovirus (insecte vecteur : Bemisia tabaci), principale famille de virus (virus à ADN circulaire simple brin monopartite ou bipartite) émergent dans la région du sud-ouest de l'océan Indien, dont la rapide évolution des génomes repose assez fortement sur des événements de recombinaison.