L'UMR PVBMT est dirigée par Bernard REYNAUD du Cirad et co-dirigée par Dominique STRASBERG de l'Université de la Réunion. Les décisions concernant la vie de l'unité sont discutées, trois fois par an, en réunions du conseil d'unité . Le conseil d'unité est composé de membres élus et de membres nommés : il représente toutes les catégories de personnel de l'unité.
Une commission utilisateurs se réunit une fois par mois.
Des assemblées générales , destinées à informer tout le personnel de l'unité, ont lieu une à deux fois par an.
L'UMR PVBMT est structurée en 5 équipes de recherche au sein de trois champs thématiques.
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