Inferences from tip-calibrated phylogenies (tip-dating) : concepts, applications and prospects in plant-pathogenic bacteria : Présentation travaux

Résumé

Le terme tip-dating désigne toute inférence réalisée en calibrant un arbre phylogénétique par ses feuilles (souvent également appelées nœuds externes). Bien que les bases conceptuelles du tip-dating aient été posées à la fin des années 1980’s, des développements récents associés aux méthodes de séquençage ainsi qu’aux modèles phylogénétiques ont suscité un engouement prononcé pour l’utilisation de tels outils d’analyse.

 Après un bref rappel sur les bases conceptuelles du tip-dating et ses conditions d’utilisation, je vous illustrerais les multiples applications offertes par cette méthodologie avec des exemples tirés de mes recherches personnelles et de la littérature. Je discuterais également les perspectives d’applications de cette méthodologie dans le cadre des bactéries phytopathogènes des plantes.