Projet Biorisk 1

Méthodes moléculaires adaptées à la surveillance de bactéries peu polymorphes à dissémination Aérienne

Objectifs :

Définir et évaluer des méthodes de typage moléculaire utilisables pour la surveillance épidémiologique en fonction du niveau de diversité génétique de l’agent pathogène considéré et de l’échelle spatiale et/ou temporelle appréhendée.
Mettre au point un schéma de séquençage de gènes conservés pour l’identification de genre, d’espèce et de pathovar pour des bactéries phytopathogènes du genreXanthomonas.
Développer une méthode PCR multiplexe pour l’identification rapide des quatre espèces responsables de la gale bactérienne des solanées à graines (tomate, piment).
Développer une méthode PCR quantitative pour la détection et la quantification in planta rapide des bactéries responsables du dépérissement bactérien de l’anthurium et du chancre des agrumes.
Développer des méthodes permettant d’identifier des gènes impliqués dans l’émergence de populations de Xanthomonas

Calendrier : 2008-2010