Diversité virale chez les insectes vecteurs: apport des approches (méta)-génomiques

Résumé

Les arthropodes sont des vecteurs efficaces de maladies infectieuses, mais ils sont aussi des hôtes de grandes communautés de microorganismes, pour la plupart inconnues. Afin d'évaluer le risque d'émergence d'agents pathogènes, il est crucial de développer de nouvelles méthodes de surveillance. Dans le cadre du consortium VMerge, nous avons mis en place un pipeline métagénomique dédié à l'analyse des communautés virales (" viromes ") en ségrégation des populations de vecteurs. Je présenterai les défis associés à l'analyse de 64 échantillons de viromes d'Aedes vexans et illustrerai leur variabilité temporelle, spatiale et environnementale. .