Séquençage du génome de Vanilla planifolia et phénomène d’endoréplication partielle

Résumé 

Le projet Vaniseq, faisant interagir un consortium public-privé regroupant des acteurs régionaux et nationaux, a permis l’obtention d’une séquence de Vanilla planifolia, espèce qui représente plus de 95 % de la production mondiale de gousses. Cet assemblage comprend 83 % de la taille attendue du génome de l’espèce et 59128 gènes y ont été annotés. Une plateforme web dédiée aux données générées autour du génome du vanillier a été mise en ligne et continue d’être enrichie afin d’en faciliter l’accès et l’exploitation au travers d’outils bioinformatique. Ce travail, a également permis d’obtenir une première image à l’échelle moléculaire de ce phénomène d’endoréplication partielle en s’appuyant sur des données de séquençage issues de différentes technologies. Des expérimentations additionnelles sont en cours afin de mieux comprendre ce mécanisme.